報恩堂創建於清咸豐十一年(西元一八六一年),主祀觀世音菩薩,乃先天派齋教的祖堂。原址位於府城東安坊右營埔,為一草庵;至光緒十二年(西元一八八六年)改為瓦石構造的齋堂;光緒二十二年(西元一八九六年)日本人徵收堂址改建臺南醫院,乃遷建今址。
報恩堂為三合院、三進兩廂的傳統建築,庭院深邃、清靜安寧,堂內空間寬敞、清幽恬靜‧呈現齋堂修身養性的氣質。神龕、花罩、八卦門諸木作,雕工精緻可賞,石礎古拙尤添古意。